FFU的典型使用方式是,新風由新風空調機處理至所需狀態后送入,在靜壓箱內與回風混合后經FFU的風機加壓后經HEPA或ULPA送入室內,再經架空地板或側墻回至干盤管,在此經冷(熱)處理后經由回壓機送回至靜壓箱完成循環。這樣的FFU系統有諸多優點：
1、系統靈活，可隨時調整
潔凈室的壁板都是以天花板格子的模數來布置，并且由于其特殊的節點構造，潔凈室的壁板可以隨時調整位置，以此改變房間的布局。如果房間的潔凈度需要調整，可以通過增減FFU數量來實現。這對于集中送風的凈化系統來說幾乎是不可能的。
2、 出風均勻穩定
FFU因為自帶風機，出風均勻而穩定。避免了集中送風系統各送風口風量平衡的問題。對于垂直單向流潔凈室尤為有利。
3、節能顯著
FFU系統風管很少，除新風以風管送達外，大量的回風以小循環的方式運行，大大的減少了風管的阻力消耗。同時由于FFU的面風速一般為0.35~0.45m/s,過濾器阻力小,FFU的無殼風機功率很小,新型的FFU采用了高效率電動機,同時對風機葉輪形狀進行了改進,其綜合效率已大幅度提高。
4、 節省空間
FFU沒有巨大的送回風管，大大的節省了安裝空間。對于層高緊張的改建項目非常合適。
5、 風口、燈具、煙感、噴淋、靜電中和器等的合理布局
這些潔凈室常用裝置在安裝時都有各自的天花板格子位置，既合理又美觀。
6、負壓密封
FFU送風系統的靜壓箱為負壓，因此即使風口安裝存在泄漏，也是從潔凈室向靜壓箱泄漏，不會形成對潔凈室的污染。
FFU系統也有缺點：
風機數量大，故障機率大。且因FFU布置在吊頂上，維修有一定困難。而集中送風系統因設備較為集中，數量也少，易于維護。
